HEMEPROTEÍNAS HUMANAS COMO MODELO PARA LOCALIZAÇÃO DE GRUPAMENTOS QUÍMICOS EM PROGRAMA GRATUITO DE SIMULAÇÃO COMPUTACIONAL DE BIOMOLÉCULAS

Resumo

Introdução: As hemeproteínas correspondem a biomoléculas que possuem em sua estrutura o grupo funcional heme. Este grupamento permite que elas desempenham diversas funções bioquímicas, como transporte de gases, catálise, transporte de elétrons, entre outras.  Na presente pesquisa, elas serão utilizadas como modelo para explicar como desenvolver scripts para identificar grupos funcionais no programa de simulação computacional RasMol. Objetivo: Desenvolver uma estratégia didática para ensinar a como desenvolver scripts localização de grupos funcionais em programas de simulação computacional de biomoléculas como o RasMol, utilizando as hemeproteínas como modelo. Metodologia: No atual estudo foi realizado um levantamento das hemeproteínas em artigos científicos e livros. Em seguida, foram buscados arquivos PDBs disponíveis no site Protein Data Bank. A partir dos arquivos PDB selecionados, foram desenvolvidos scripts para o software RasMol para produção de imagens tridimensionais que destacassem os grupos heme. Resultados: As hemeproteínas selecionadas foram organizadas em quatro grupos de acordo com sua função: a) transporte de elétrons; b) ligações com gases; c) decomposição de peróxidos e d) funções variadas. Para cada biomolécula destes grupos, foi desenvolvido um script onde as proteínas são apresentadas no modo Wireframe e os grupos heme no modo Spacefill. Conclusão: O software RasMol é um programa de simulação computacional de biomoléculas gratuito e, portanto, acessível como ferramenta de Bioinformática para estudantes de diferentes níveis de ensino. Sua simplicidade se deve a necessidade de elaboração de poucos comandos, o que torna possível apreender facilmente a desenvolver scripts para localização de grupamentos químicos funcionais.